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核酸濃度檢測(二)——讀數解讀及注意事項

更新日期:2017年3月24日 大字 小字

我們獲得了Micro Drop超微量分光光度計檢測結果后,對光譜的正確分析至關(guān)重要。


出結果的含義

1. A260nm——核酸更高吸收峰的吸收波長(cháng)。

2. A280nm——蛋白更高吸收峰的吸收波長(cháng)。

3. A230nm——是碳水化合物更高吸收峰的吸收波長(cháng)。

4. A340nm——是基線(xiàn)校準波長(cháng),為檢測溶液樣品的濁度和其他干擾因子。該值應該接近0.0。如果不是,表明溶液中有懸浮物,需要純化樣品。純樣品的A340一般是0。

   A230產(chǎn)生負值主要是由于在很低 DNA 濃度的溶液中的一些其他成分的干擾所導致的。在下一個(gè)測定中,需要降低樣品的稀釋度,A230的負值會(huì )被校正。

   A260/A280比值可進(jìn)行核酸樣品純度評估:純DNA的A260/A280比值為1.8,純 RNA的A260/A280比值為2.0。如果比值低,表示受到蛋白(芳香族)或酚類(lèi)物質(zhì)的污染,需要純化樣品。

●   A260/A230比值可進(jìn)行核酸樣品純度評估:純 DNA和RNA的A260/A230比值為 1.8 – 2.2。若比值小于1.8表明樣品被碳水化合物(糖類(lèi))、鹽類(lèi)或有機溶劑污染,需要純化樣品。當 260/230<1 時(shí),通常只有兩種情況。一是胍鹽污染,二是蛋白污染。


本的不同提取方法對檢測的影響: 

●   苯酚/ Trizol萃取——殘留試劑污染可以通過(guò)220至240nm之間的異常光譜以及260至280nm區域的偏移來(lái)表示。加氯仿離心后取上清的時(shí)候千萬(wàn)不要貪多,那樣就很容易被蛋白污染。

●   純化柱提取——殘留胍可能有助于230nm附近的峰值和從230nm到240nm的波谷偏移。

●   磁珠法提取——殘余珠可能會(huì )導致光散射,并導致異常光譜。

操作注意事項: 

1. A260/A280、A260/A230比值受溶液酸堿度及離子強度的影響,如酸溶液會(huì )使A260/A280比值降低,低離子強度和低 pH 溶液會(huì )增加 280 nm 處的光吸收值。因此必須確??瞻讬z測和溶解樣品所用Buffer的離子濃度和pH值一致。

2. 濃度接近2 ng/μl濃度的樣品可能會(huì )導致不可靠的260/280和/或260/230的比值。

3. 樣品的稀釋濃度同樣是不可忽視的因素,由于樣品中不可避免存在一些細小的顆粒,尤其是核酸樣品。這些小顆粒的存在會(huì )干擾測試效果。樣品的濃度不能過(guò)低,或者過(guò)高(超過(guò)光度計的測試范圍)。

4. 樣品混合要充分,否則吸光值太低,甚至出現負值;混合液不能存在氣泡,空白液無(wú)懸浮物,否則讀數漂移劇烈。樣品混合不均勻會(huì )直接導致檢測不確定,重復性低。

5. 樣品檢測上樣量不能太少,必須能夠保證能后連接上下兩根光纖形成光柱,從而使得檢測正常進(jìn)行。

6. 樣品臺清潔,在檢測前,檢測后以及連續使用儀器30分鐘后均需要對上下接觸樣品的部位用雙蒸水或純水擦拭。

7. 切忌不可用噴壺在樣品臺上噴射,以防液體液體進(jìn)入儀器內部造成損壞。

8. 切忌不可用洗滌劑或異丙醇清潔基座。

9. 儀器放置位置應當遠離通風(fēng)口,以免液滴蒸發(fā)太快導致濃度讀數偏大。

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